Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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