Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms