Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms