Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms