Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PARP3Q9Y6F1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms