Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms