Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms