Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms