Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms