Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms