Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms