Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms