Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms