Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms