Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SH3BP4Q9P0V3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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