Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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