Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms