Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms