Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms