Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRCC1Q9NPI7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms