Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms