Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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