Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF407Q9C0G0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF407Q9C0G0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF407Q9C0G0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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