Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHACTR1Q9C0D0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms