Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms