Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms