Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms