Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms