Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms