Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms