Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms