Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms