Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms