Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms