Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms