Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORT1Q99523 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms