Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms