Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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