Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms