Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE2Q96DL1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms