Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms