Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHIPQ8WWQ0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms