Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms