Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL4L1Q8NHW4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms