Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD1Q8NHV4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms