Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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LNX2Q8N448 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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