Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms