Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms