Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms