Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms